This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
150 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180507857
OCAT01006743
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180507316
OCAT01000461
37213
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180507244
OCAT01000316
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180508102
OCAT01025500
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180507278
OCAT01000387
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507378
OCAT01000747
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507380
OCAT01000747
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507383
OCAT01000748
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507733
OCAT01003823
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507735
OCAT01003823
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180508064
OCAT01021095
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507496
OCAT01001245
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180508150
OCAT01034296
267556
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507906
OCAT01008709
267556
Bacillota
TAC
Val
>WENV180508247
OCAT01052389
339890
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180508094
OCAT01023628
10560
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180508173
OCAT01037690
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180507816
OCAT01005576
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180508157
OCAT01034914
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507942
OCAT01010907
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507617
OCAT01002108
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507642
OCAT01002251
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180508321
OCAT01094830
250201
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180507806
OCAT01005323
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180507663
OCAT01002451
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180508286
OCAT01068675
356488
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180508226
OCAT01047737
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180508164
OCAT01036991
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180508307
OCAT01080273
340146
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180507461
OCAT01001081
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180508235
OCAT01048378
246023
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180508204
OCAT01041119
162003
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180508160
OCAT01035971
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180508025
OCAT01017214
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180508167
OCAT01037060
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180508077
OCAT01022367
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180507913
OCAT01008899
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180508282
OCAT01065405
235294
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180508205
OCAT01041119
338208
Bacillota
>WENV180507456
OCAT01001077
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180507251
OCAT01000326
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180507219
OCAT01000298
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180507988
OCAT01013648
341763
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180508343
OCAT01109261
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507902
OCAT01008653
182792
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507823
OCAT01005635
182792
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507523
OCAT01001417
182792
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507019
OCAT01000036
182792
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507583
OCAT01001744
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180507015
OCAT01000036
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180507018
OCAT01000036
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180507250
OCAT01000326
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV180508277
OCAT01064012
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180507900
OCAT01008653
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507020
OCAT01000036
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507460
OCAT01001081
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180507295
OCAT01000446
149041
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507135
OCAT01000168
149041
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507935
OCAT01010596
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180507325
OCAT01000495
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180507415
OCAT01000888
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180507416
OCAT01000920
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180507201
OCAT01000293
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180507069
OCAT01000071
173810
Bacillota
CAT
Met
>WENV180508022
OCAT01016999
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180508020
OCAT01016999
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180507632
OCAT01002163
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180506974
OCAT01000009
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180508038
OCAT01018559
411585
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180508344
OCAT01109273
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180508317
OCAT01088280
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180507529
OCAT01001452
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180507455
OCAT01001077
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180507497
OCAT01001245
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180507776
OCAT01004526
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180507414
OCAT01000888
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180507347
OCAT01000582
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180507071
OCAT01000071
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180507807
OCAT01005323
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180507664
OCAT01002451
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180507494
OCAT01001245
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180508263
OCAT01058155
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180507824
OCAT01005635
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180507821
OCAT01005635
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180507524
OCAT01001417
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180507522
OCAT01001417
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180507971
OCAT01012645
344183
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180507297
OCAT01000446
239832
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180507133
OCAT01000168
239832
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180507249
OCAT01000326
152151
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507604
OCAT01002035
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180507413
OCAT01000888
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180507994
OCAT01014319
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180507739
OCAT01003947
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180507543
OCAT01001521
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180507574
OCAT01001697
256380
Bacillota
>WENV180507445
OCAT01001050
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180507188
OCAT01000262
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180508302
OCAT01074469
147674
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180508251
OCAT01055533
147674
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507756
OCAT01004241
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180507637
OCAT01002201
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180507809
OCAT01005344
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180507607
OCAT01002070
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180507950
OCAT01011557
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180507862
OCAT01007048
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180507813
OCAT01005421
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507224
OCAT01000298
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507217
OCAT01000298
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507211
OCAT01000298
144672
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180508287
OCAT01068675
102996
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180508188
OCAT01039174
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180507822
OCAT01005635
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180507521
OCAT01001417
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180507742
OCAT01004032
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507565
OCAT01001651
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180508292
OCAT01069678
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180507326
OCAT01000495
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180507242
OCAT01000315
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180508178
OCAT01037890
235292
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180507662
OCAT01002451
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180507552
OCAT01001579
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180507515
OCAT01001396
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180507256
OCAT01000336
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180508206
OCAT01041119
144762
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507728
OCAT01003736
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180507925
OCAT01009671
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180507839
OCAT01005860
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180507454
OCAT01001077
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180507555
OCAT01001587
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180507546
OCAT01001529
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180507872
OCAT01007592
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180507519
OCAT01001414
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507444
OCAT01001050
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507352
OCAT01000612
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507187
OCAT01000262
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507105
OCAT01000129
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180507693
OCAT01003056
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180507997
OCAT01015096
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180507702
OCAT01003206
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180507275
OCAT01000379
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180507903
OCAT01008653
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180507901
OCAT01008653
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180507021
OCAT01000036
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180507017
OCAT01000036
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180507848
OCAT01006206
338131
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180508143
OCAT01032274
338207
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507922
OCAT01009354
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507624
OCAT01002112
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180507510
OCAT01001337
338128
Bacillota
TTC
Glu
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK