This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
236 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180937598
ODTX01000002
267632
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180937629
ODTX01000011
267632
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180937855
ODTX01000121
235615
Actinomycetota
TGC
Ala
>WENV180937902
ODTX01000180
235615
Actinomycetota
TGC
Ala
>WENV180938251
ODTX01001096
38355
Actinomycetota
GAG
Leu
>WENV180938765
ODTX01006458
413566
Actinomycetota
CCC
Gly
>WENV180938909
ODTX01009724
413566
Actinomycetota
CCC
Gly
>WENV180939067
ODTX01014051
413566
Actinomycetota
CCC
Gly
>WENV180939085
ODTX01014601
413566
Actinomycetota
CCC
Gly
>WENV180940162
ODTX01287383
413566
Actinomycetota
CCC
Gly
>WENV180938051
ODTX01000476
240126
Actinomycetota
GTG
His
>WENV180939476
ODTX01041537
240126
Actinomycetota
GTG
His
>WENV180938708
ODTX01005392
345178
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180937752
ODTX01000062
235606
Actinomycetota
GGT
Thr
>WENV180937651
ODTX01000018
235606
Actinomycetota
GGT
Thr
>WENV180939705
ODTX01074052
246840
Actinomycetota
CAC
Val
>WENV180938873
ODTX01008738
246840
Actinomycetota
CAC
Val
>WENV180939829
ODTX01102824
361079
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180939178
ODTX01019264
361079
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180939088
ODTX01014866
361079
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180939060
ODTX01013835
361079
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180938962
ODTX01011011
361079
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180938338
ODTX01001452
361079
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180939983
ODTX01160960
340959
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180939892
ODTX01123952
340959
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180939804
ODTX01093945
340959
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180938743
ODTX01006037
340959
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180938536
ODTX01002874
340959
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180938212
ODTX01000925
340959
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180938549
ODTX01003121
259184
Actinomycetota
GTG
His
>WENV180938384
ODTX01001700
259184
Actinomycetota
GTG
His
>WENV180939842
ODTX01105443
158373
Actinomycetota
GGG
Pro
>WENV180939286
ODTX01024236
158373
Actinomycetota
GGG
Pro
>WENV180938728
ODTX01005754
158373
Actinomycetota
GGG
Pro
>WENV180938608
ODTX01004092
158373
Actinomycetota
GGG
Pro
>WENV180938594
ODTX01003876
158373
Actinomycetota
GGG
Pro
>WENV180938482
ODTX01002318
158373
Actinomycetota
GGG
Pro
>WENV180938222
ODTX01000958
158373
Actinomycetota
GGG
Pro
>WENV180940167
ODTX01288531
149272
Actinomycetota
TTT
Lys
>WENV180939861
ODTX01108612
149272
Actinomycetota
TTT
Lys
>WENV180939811
ODTX01096406
149272
Actinomycetota
TTT
Lys
>WENV180939756
ODTX01082503
149272
Actinomycetota
TTT
Lys
>WENV180939664
ODTX01066404
149272
Actinomycetota
TTT
Lys
>WENV180938948
ODTX01010406
149272
Actinomycetota
TTT
Lys
>WENV180938378
ODTX01001692
418439
Actinomycetota
TCC
Gly
>WENV180938275
ODTX01001176
418439
Actinomycetota
TCC
Gly
>WENV180939045
ODTX01013534
235734
Actinomycetota
>WENV180938330
ODTX01001438
235734
Actinomycetota
>WENV180939149
ODTX01017295
161605
Actinomycetota
CAT
Met
>WENV180937596
ODTX01000002
145272
Actinomycetota
CAT
Met
>WENV180939536
ODTX01048237
96367
Actinomycetota
GTA
Tyr
>WENV180938936
ODTX01010035
96367
Actinomycetota
GTA
Tyr
>WENV180937664
ODTX01000020
341846
Actinomycetota
TCC
Gly
>WENV180937594
ODTX01000002
341846
Actinomycetota
TCC
Gly
>WENV180938702
ODTX01005220
84037
Actinomycetota
CAG
Leu
>WENV180938690
ODTX01005076
84037
Actinomycetota
CAG
Leu
>WENV180937923
ODTX01000206
235610
Actinomycetota
TGT
Thr
>WENV180940052
ODTX01202234
412871
Actinomycetota
GCA
Cys
>WENV180938165
ODTX01000769
338389
Actinomycetota
CAC
Val
>WENV180937827
ODTX01000103
338389
Actinomycetota
CAC
Val
>WENV180938270
ODTX01001152
235663
Actinomycetota
TTT
Lys
>WENV180938188
ODTX01000821
235663
Actinomycetota
TTT
Lys
>WENV180939910
ODTX01130963
240122
Actinomycetota
TGT
Thr
>WENV180938663
ODTX01004759
240122
Actinomycetota
TGT
Thr
>WENV180938588
ODTX01003735
240122
Actinomycetota
TGT
Thr
>WENV180938195
ODTX01000856
240122
Actinomycetota
TGT
Thr
>WENV180937901
ODTX01000180
145052
Actinomycetota
GAT
Ile
>WENV180938034
ODTX01000429
241627
Actinomycetota
>WENV180937753
ODTX01000062
338474
Actinomycetota
CAT
Met
>WENV180940175
ODTX01289340
254819
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180938956
ODTX01010720
254819
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180938955
ODTX01010720
254819
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180939047
ODTX01013534
339641
Actinomycetota
GAC
Val
>WENV180938332
ODTX01001438
339641
Actinomycetota
GAC
Val
>WENV180938989
ODTX01011585
246789
Actinomycetota
CCT
Arg
>WENV180938547
ODTX01003090
246789
Actinomycetota
CCT
Arg
>WENV180939046
ODTX01013534
411803
Actinomycetota
GCA
Cys
>WENV180938331
ODTX01001438
411803
Actinomycetota
GCA
Cys
>WENV180939535
ODTX01048177
16591
Actinomycetota
GAG
Leu
>WENV180938434
ODTX01001929
16591
Actinomycetota
GAG
Leu
>WENV180938211
ODTX01000910
16591
Actinomycetota
GAG
Leu
>WENV180938201
ODTX01000879
16591
Actinomycetota
GAG
Leu
>WENV180938945
ODTX01010294
415620
Actinomycetota
TCC
Gly
>WENV180938550
ODTX01003174
415620
Actinomycetota
TCC
Gly
>WENV180939538
ODTX01048237
149271
Actinomycetota
CAT
Met
>WENV180938064
ODTX01000493
246015
Actinomycetota
GTG
His
>WENV180937695
ODTX01000031
44930
Actinomycetota
GGA
Ser
>WENV180938012
ODTX01000384
239204
Actinomycetota
CTT
Lys
>WENV180938011
ODTX01000384
239204
Actinomycetota
CTT
Lys
>WENV180939921
ODTX01136573
155366
Actinomycetota
GAA
Phe
>WENV180939317
ODTX01026651
96366
Actinomycetota
TAG
Leu
>WENV180939044
ODTX01013523
96366
Actinomycetota
TAG
Leu
>WENV180938277
ODTX01001184
96366
Actinomycetota
TAG
Leu
>WENV180937689
ODTX01000027
235662
Actinomycetota
TGT
Thr
>WENV180938910
ODTX01009748
246807
Actinomycetota
TGC
Ala
>WENV180938214
ODTX01000927
246807
Actinomycetota
TGC
Ala
>WENV180938968
ODTX01011030
246791
Actinomycetota
TCT
Arg
>WENV180938402
ODTX01001819
246791
Actinomycetota
TCT
Arg
>WENV180937812
ODTX01000090
37093
Actinomycetota
GAG
Leu
>WENV180939201
ODTX01020136
23975
Actinomycetota
GCT
Ser
>WENV180938907
ODTX01009707
23975
Actinomycetota
GCT
Ser
>WENV180937754
ODTX01000062
250703
Actinomycetota
CCA
Trp
>WENV180938447
ODTX01002047
121559
Actinomycetota
>WENV180938245
ODTX01001073
121559
Actinomycetota
>WENV180940122
ODTX01257157
148467
Actinomycetota
CAT
Met
>WENV180938952
ODTX01010658
246299
Actinomycetota
CTT
Lys
>WENV180938322
ODTX01001400
246299
Actinomycetota
CTT
Lys
>WENV180938183
ODTX01000790
246299
Actinomycetota
CTT
Lys
>WENV180938009
ODTX01000374
411740
Actinomycetota
CCC
Gly
>WENV180937863
ODTX01000132
411740
Actinomycetota
CCC
Gly
>WENV180937933
ODTX01000220
235388
Actinomycetota
GTG
His
>WENV180937649
ODTX01000017
235388
Actinomycetota
GTG
His
>WENV180937946
ODTX01000263
148463
Actinomycetota
TAA
Leu
>WENV180937996
ODTX01000352
363051
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180939519
ODTX01046726
246222
Actinomycetota
CCG
Arg
>WENV180939255
ODTX01021851
246222
Actinomycetota
CCG
Arg
>WENV180938916
ODTX01009846
246222
Actinomycetota
CCG
Arg
>WENV180938635
ODTX01004418
246222
Actinomycetota
CCG
Arg
>WENV180938308
ODTX01001318
246222
Actinomycetota
CCG
Arg
>WENV180937826
ODTX01000103
411682
Actinomycetota
GCA
Cys
>WENV180937704
ODTX01000034
411682
Actinomycetota
GCA
Cys
>WENV180939075
ODTX01014265
260823
Actinomycetota
TGC
Ala
>WENV180939039
ODTX01013359
260823
Actinomycetota
TGC
Ala
>WENV180938404
ODTX01001827
260823
Actinomycetota
TGC
Ala
>WENV180938046
ODTX01000455
260823
Actinomycetota
TGC
Ala
>WENV180939979
ODTX01159196
37359
Actinomycetota
>WENV180939222
ODTX01020734
37359
Actinomycetota
>WENV180939172
ODTX01018807
37359
Actinomycetota
>WENV180939031
ODTX01012982
37359
Actinomycetota
>WENV180938571
ODTX01003514
284330
Actinomycetota
TTT
Lys
>WENV180940011
ODTX01177570
149270
Actinomycetota
GTC
Asp
>WENV180939661
ODTX01065010
151943
Actinomycetota
>WENV180938570
ODTX01003496
345170
Actinomycetota
TTG
Gln
>WENV180938566
ODTX01003474
45767
Actinomycetota
GGA
Ser
>WENV180938486
ODTX01002335
45767
Actinomycetota
GGA
Ser
>WENV180939503
ODTX01044858
152190
Actinomycetota
GAT
Ile
>WENV180939074
ODTX01014265
152190
Actinomycetota
GAT
Ile
>WENV180939038
ODTX01013359
152190
Actinomycetota
GAT
Ile
>WENV180938403
ODTX01001827
152190
Actinomycetota
GAT
Ile
>WENV180938086
ODTX01000568
152190
Actinomycetota
GAT
Ile
>WENV180938045
ODTX01000455
152190
Actinomycetota
GAT
Ile
>WENV180938582
ODTX01003689
60896
Actinomycetota
CAG
Leu
>WENV180939510
ODTX01045659
280137
Actinomycetota
CTT
Lys
>WENV180939509
ODTX01045659
280137
Actinomycetota
CTT
Lys
>WENV180939508
ODTX01045659
280137
Actinomycetota
CTT
Lys
>WENV180938748
ODTX01006103
240123
Actinomycetota
TAC
Val
>WENV180938213
ODTX01000925
240123
Actinomycetota
TAC
Val
>WENV180938273
ODTX01001163
345027
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180939089
ODTX01014895
345171
Actinomycetota
CAC
Val
>WENV180938996
ODTX01011793
97617
Actinomycetota
GTA
Tyr
>WENV180938647
ODTX01004480
97617
Actinomycetota
GTA
Tyr
>WENV180940161
ODTX01285725
48036
Actinomycetota
CGA
Ser
>WENV180939035
ODTX01013277
48036
Actinomycetota
CGA
Ser
>WENV180938545
ODTX01003002
363559
Actinomycetota
CAC
Val
>WENV180940190
ODTX01290170
240121
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180940145
ODTX01273782
240121
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180939391
ODTX01032582
240121
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180939179
ODTX01019264
240121
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180938887
ODTX01009114
240121
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180938281
ODTX01001202
248046
Actinomycetota
CCA
Trp
>WENV180937992
ODTX01000342
248046
Actinomycetota
CCA
Trp
>WENV180938525
ODTX01002676
287977
Actinomycetota
GTG
His
>WENV180937662
ODTX01000020
287977
Actinomycetota
GTG
His
>WENV180939379
ODTX01031242
149269
Actinomycetota
TGG
Pro
>WENV180938426
ODTX01001886
11157
Actinomycetota
GCT
Ser
>WENV180937755
ODTX01000063
58781
Actinomycetota
CAG
Leu
>WENV180939947
ODTX01146182
340958
Actinomycetota
TTG
Gln
>WENV180939353
ODTX01029836
340958
Actinomycetota
TTG
Gln
>WENV180938174
ODTX01000782
235613
Actinomycetota
GAA
Phe
>WENV180937931
ODTX01000218
145085
Actinomycetota
CAA
Leu
>WENV180937885
ODTX01000157
145085
Actinomycetota
CAA
Leu
>WENV180939229
ODTX01021382
246806
Actinomycetota
TGT
Thr
>WENV180939004
ODTX01012112
246806
Actinomycetota
TGT
Thr
>WENV180938584
ODTX01003714
246806
Actinomycetota
TGT
Thr
>WENV180938401
ODTX01001819
239183
Actinomycetota
GTG
His
>WENV180940158
ODTX01281384
59716
Actinomycetota
CAG
Leu
>WENV180939448
ODTX01038366
59716
Actinomycetota
CAG
Leu
>WENV180938947
ODTX01010405
59716
Actinomycetota
CAG
Leu
>WENV180938958
ODTX01010791
273134
Actinomycetota
CCT
Arg
>WENV180939778
ODTX01088064
153915
Actinomycetota
ACG
Arg
>WENV180938546
ODTX01003076
241612
Actinomycetota
CTT
Lys
>WENV180939869
ODTX01113274
246365
Actinomycetota
ACG
Arg
>WENV180937652
ODTX01000018
340329
Actinomycetota
CAT
Met
>WENV180939197
ODTX01019920
345177
Actinomycetota
CAC
Val
>WENV180938831
ODTX01007942
345177
Actinomycetota
CAC
Val
>WENV180938595
ODTX01003879
345177
Actinomycetota
CAC
Val
>WENV180939785
ODTX01089290
40752
Actinomycetota
GAG
Leu
>WENV180939529
ODTX01047478
40752
Actinomycetota
GAG
Leu
>WENV180938140
ODTX01000732
280065
Actinomycetota
CGT
Thr
>WENV180937597
ODTX01000002
243424
Actinomycetota
TAC
Val
>WENV180939551
ODTX01049810
254820
Actinomycetota
TAC
Val
>WENV180938505
ODTX01002503
254820
Actinomycetota
TAC
Val
>WENV180937796
ODTX01000078
235603
Actinomycetota
CCG
Arg
>WENV180938721
ODTX01005585
37358
Actinomycetota
TGA
Ser
>WENV180939740
ODTX01077363
240124
Actinomycetota
CGT
Thr
>WENV180938804
ODTX01007410
240124
Actinomycetota
CGT
Thr
>WENV180938689
ODTX01005068
240124
Actinomycetota
CGT
Thr
>WENV180938585
ODTX01003717
240124
Actinomycetota
CGT
Thr
>WENV180938856
ODTX01008194
3306
Actinomycetota
TAT
Ile
>WENV180938782
ODTX01006908
3306
Actinomycetota
TAT
Ile
>WENV180938544
ODTX01003002
235575
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180938498
ODTX01002455
235575
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180937817
ODTX01000097
235575
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180937645
ODTX01000017
235575
Actinomycetota
CTC
Glu
>WENV180939782
ODTX01088920
417269
Actinomycetota
CCC
Gly
>WENV180939267
ODTX01022733
417269
Actinomycetota
CCC
Gly
>WENV180938128
ODTX01000698
417269
Actinomycetota
CCC
Gly
>WENV180939365
ODTX01030585
235604
Actinomycetota
CCT
Arg
>WENV180940189
ODTX01290155
236216
Actinomycetota
GGC
Ala
>WENV180939849
ODTX01106224
236216
Actinomycetota
GGC
Ala
>WENV180939265
ODTX01022479
236216
Actinomycetota
GGC
Ala
>WENV180938850
ODTX01008128
236216
Actinomycetota
GGC
Ala
>WENV180938286
ODTX01001249
236216
Actinomycetota
GGC
Ala
>WENV180937939
ODTX01000238
235768
Actinomycetota
CGT
Thr
>WENV180939649
ODTX01063923
155332
Actinomycetota
TAA
Leu
>WENV180938527
ODTX01002696
345176
Actinomycetota
CCG
Arg
>WENV180938362
ODTX01001601
345176
Actinomycetota
CCG
Arg
>WENV180938543
ODTX01003002
370403
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180937816
ODTX01000097
370403
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180939823
ODTX01100605
345416
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180938954
ODTX01010720
345416
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180938990
ODTX01011626
154637
Actinomycetota
CAA
Leu
>WENV180938227
ODTX01000984
154637
Actinomycetota
CAA
Leu
>WENV180937997
ODTX01000352
285954
Actinomycetota
>WENV180937930
ODTX01000218
285954
Actinomycetota
>WENV180939993
ODTX01166108
37773
Actinomycetota
CGA
Ser
>WENV180937630
ODTX01000011
235614
Actinomycetota
TAC
Val
>WENV180938070
ODTX01000532
235612
Actinomycetota
TTC
Glu
>WENV180938381
ODTX01001697
246800
Actinomycetota
CAT
Met
>WENV180940007
ODTX01174662
412870
Actinomycetota
TCC
Gly
>WENV180938062
ODTX01000492
16836
Actinomycetota
CGA
Ser
>WENV180937700
ODTX01000031
16836
Actinomycetota
CGA
Ser
>WENV180938357
ODTX01001564
261571
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180938340
ODTX01001459
261571
Actinomycetota
GTT
Asn
>WENV180938033
ODTX01000429
338388
Actinomycetota
CTG
Gln
>WENV180937631
ODTX01000011
155350
Actinomycetota
CAT
Met
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK