This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
111 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183549846
OOAZ01025159
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183549740
OOAZ01010370
37213
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183549260
OOAZ01000460
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183549272
OOAZ01000484
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183549440
OOAZ01001411
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183549785
OOAZ01015241
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183549862
OOAZ01026675
235287
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183549277
OOAZ01000492
267556
Bacillota
TAC
Val
>WENV183549675
OOAZ01006886
267556
Bacillota
TAC
Val
>WENV183549411
OOAZ01001105
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183549351
OOAZ01000809
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183549319
OOAZ01000629
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183549323
OOAZ01000638
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183549695
OOAZ01007943
237387
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183549361
OOAZ01000845
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183549332
OOAZ01000707
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183549228
OOAZ01000337
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183549857
OOAZ01026675
356488
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183549193
OOAZ01000239
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183549890
OOAZ01036106
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183549040
OOAZ01000048
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183549807
OOAZ01017172
155273
Bacillota
CAT
Met
>WENV183549774
OOAZ01013207
155273
Bacillota
CAT
Met
>WENV183549735
OOAZ01010189
235294
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183549321
OOAZ01000638
341763
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183549650
OOAZ01005903
182792
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183549470
OOAZ01001558
182792
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183549451
OOAZ01001458
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183549445
OOAZ01001452
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183549328
OOAZ01000695
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183549861
OOAZ01026675
235290
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183549169
OOAZ01000185
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183549155
OOAZ01000167
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183549769
OOAZ01012751
144763
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183549700
OOAZ01007943
162028
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183549889
OOAZ01036106
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183549619
OOAZ01004803
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183549613
OOAZ01004614
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183549225
OOAZ01000334
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183549492
OOAZ01001727
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183549270
OOAZ01000480
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183549258
OOAZ01000459
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183549045
OOAZ01000051
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183549828
OOAZ01022060
340131
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183549824
OOAZ01019689
155089
Bacillota
CAT
Met
>WENV183549466
OOAZ01001539
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV183549515
OOAZ01002054
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183549662
OOAZ01006369
153911
Bacillota
GAT
Ile
>WENV183549205
OOAZ01000269
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183549750
OOAZ01011193
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183549491
OOAZ01001727
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183549398
OOAZ01000998
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183549326
OOAZ01000689
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183549269
OOAZ01000480
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183549257
OOAZ01000459
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183549026
OOAZ01000032
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183549337
OOAZ01000736
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183549088
OOAZ01000087
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183549362
OOAZ01000845
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183549333
OOAZ01000707
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183549229
OOAZ01000337
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183549864
OOAZ01026675
411584
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183549737
OOAZ01010295
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183549651
OOAZ01005903
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183549471
OOAZ01001558
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183549679
OOAZ01006949
241471
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183549885
OOAZ01035680
239832
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183549699
OOAZ01007943
37193
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183549845
OOAZ01024799
144962
Bacillota
CAT
Met
>WENV183549559
OOAZ01002913
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183549464
OOAZ01001526
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183549256
OOAZ01000459
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183549808
OOAZ01017172
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183549770
OOAZ01012751
144767
Bacillota
GTG
His
>WENV183549514
OOAZ01002053
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183549450
OOAZ01001457
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183549372
OOAZ01000894
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183549574
OOAZ01003327
256380
Bacillota
>WENV183549859
OOAZ01026675
113612
Bacillota
TAG
Leu
>WENV183549624
OOAZ01004927
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183549521
OOAZ01002153
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183549416
OOAZ01001130
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183549197
OOAZ01000245
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183549208
OOAZ01000271
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183549718
OOAZ01009199
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183549674
OOAZ01006866
419877
Bacillota
TCC
Gly
>WENV183549649
OOAZ01005903
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183549469
OOAZ01001558
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183549544
OOAZ01002555
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183549631
OOAZ01005023
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183549620
OOAZ01004803
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183549614
OOAZ01004614
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183549226
OOAZ01000334
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183549202
OOAZ01000253
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183549860
OOAZ01026675
144762
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183549543
OOAZ01002549
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183549254
OOAZ01000454
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183549421
OOAZ01001167
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183549426
OOAZ01001260
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV183549031
OOAZ01000038
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183549396
OOAZ01000981
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183549164
OOAZ01000175
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183549161
OOAZ01000169
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV183549693
OOAZ01007943
146770
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183549432
OOAZ01001336
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183549418
OOAZ01001154
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183549170
OOAZ01000185
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183549156
OOAZ01000167
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183549738
OOAZ01010298
273862
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183549223
OOAZ01000324
338131
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183549529
OOAZ01002258
338128
Bacillota
TTC
Glu
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK