This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
211 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180601263
OCPQ01016916
24650
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180601421
OCPQ01040793
361659
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601583
OCPQ01091406
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180600325
OCPQ01000008
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180600386
OCPQ01000035
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180600429
OCPQ01000055
267556
Bacillota
TAC
Val
>WENV180601428
OCPQ01042005
267556
Bacillota
TAC
Val
>WENV180601635
OCPQ01128972
267556
Bacillota
TAC
Val
>WENV180600839
OCPQ01001673
339890
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180601122
OCPQ01007167
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180601095
OCPQ01006275
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180601075
OCPQ01005703
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180600896
OCPQ01002377
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV180601462
OCPQ01049081
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180600774
OCPQ01001085
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180600535
OCPQ01000243
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180600968
OCPQ01003797
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180600920
OCPQ01002925
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180601448
OCPQ01047188
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180600863
OCPQ01001948
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180600776
OCPQ01001087
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180601276
OCPQ01017824
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180601249
OCPQ01015384
37071
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180601097
OCPQ01006315
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180601070
OCPQ01005605
162003
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601453
OCPQ01047548
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180601415
OCPQ01039813
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180601625
OCPQ01126834
97943
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180601277
OCPQ01017841
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180600833
OCPQ01001646
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180600777
OCPQ01001095
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180600616
OCPQ01000450
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180601641
OCPQ01129074
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180601420
OCPQ01040793
114359
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180601339
OCPQ01025981
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180601354
OCPQ01027878
235294
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180601626
OCPQ01126904
338208
Bacillota
>WENV180600814
OCPQ01001439
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180600723
OCPQ01000806
428544
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180600809
OCPQ01001435
291442
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180601317
OCPQ01023532
235114
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180601327
OCPQ01023992
235114
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180600701
OCPQ01000729
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601628
OCPQ01126959
182792
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601556
OCPQ01075570
182792
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601158
OCPQ01009447
182792
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601471
OCPQ01051902
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180601013
OCPQ01004526
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180601633
OCPQ01128606
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180600916
OCPQ01002858
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180601600
OCPQ01105675
186380
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601299
OCPQ01021294
186380
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601295
OCPQ01021294
186380
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601223
OCPQ01013001
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180601124
OCPQ01007375
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180601234
OCPQ01014113
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180601157
OCPQ01009447
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180600806
OCPQ01001425
338550
Bacillota
>WENV180600780
OCPQ01001131
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180600729
OCPQ01000825
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180601384
OCPQ01033747
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180601159
OCPQ01009447
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180601120
OCPQ01007125
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180600977
OCPQ01003907
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180600501
OCPQ01000185
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180601241
OCPQ01014808
144763
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180600955
OCPQ01003550
16266
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180601275
OCPQ01017824
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180601349
OCPQ01027302
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180601211
OCPQ01012308
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180600978
OCPQ01003907
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180600722
OCPQ01000806
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180600551
OCPQ01000296
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180600397
OCPQ01000036
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601397
OCPQ01035252
144766
Bacillota
CAT
Met
>WENV180601376
OCPQ01032544
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180601055
OCPQ01005489
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180600884
OCPQ01002243
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180601544
OCPQ01072505
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180600375
OCPQ01000029
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180601461
OCPQ01049081
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180600534
OCPQ01000243
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180601101
OCPQ01006342
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180600654
OCPQ01000562
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180601602
OCPQ01106776
173810
Bacillota
CAT
Met
>WENV180601622
OCPQ01126308
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180601390
OCPQ01034695
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180601015
OCPQ01004550
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180600426
OCPQ01000052
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180601436
OCPQ01044370
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180600712
OCPQ01000778
235078
Bacillota
TAC
Val
>WENV180600499
OCPQ01000185
235078
Bacillota
TAC
Val
>WENV180600590
OCPQ01000397
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180601325
OCPQ01023992
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180600813
OCPQ01001439
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180600680
OCPQ01000643
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180600594
OCPQ01000400
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180601271
OCPQ01017383
353537
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180600715
OCPQ01000778
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601145
OCPQ01008365
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180601056
OCPQ01005551
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180600901
OCPQ01002458
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180600883
OCPQ01002243
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180600831
OCPQ01001623
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180600372
OCPQ01000027
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180600969
OCPQ01003797
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180600921
OCPQ01002925
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180601298
OCPQ01021294
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180601294
OCPQ01021294
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180600720
OCPQ01000806
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180600394
OCPQ01000036
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180600708
OCPQ01000742
412387
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180601068
OCPQ01005605
411584
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180601226
OCPQ01013310
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180601174
OCPQ01009893
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180601143
OCPQ01008222
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180600971
OCPQ01003860
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180601369
OCPQ01029548
239832
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180601423
OCPQ01040793
150597
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180600679
OCPQ01000643
152151
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180601516
OCPQ01060123
250349
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180600880
OCPQ01002232
419639
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180601244
OCPQ01014973
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180601108
OCPQ01006494
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180600756
OCPQ01000954
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180601236
OCPQ01014394
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180600989
OCPQ01004167
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180601456
OCPQ01047548
245386
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180600943
OCPQ01003346
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180600987
OCPQ01004080
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180601183
OCPQ01010426
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180600751
OCPQ01000936
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180600919
OCPQ01002902
256380
Bacillota
>WENV180601503
OCPQ01058400
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180600840
OCPQ01001673
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180601515
OCPQ01060123
235197
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601533
OCPQ01065293
147674
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180600837
OCPQ01001673
147674
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180601450
OCPQ01047188
241432
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180601586
OCPQ01091410
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180601422
OCPQ01040793
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180601543
OCPQ01072356
235638
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180601118
OCPQ01007090
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180601111
OCPQ01006787
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180601106
OCPQ01006372
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180601035
OCPQ01004825
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180601489
OCPQ01055896
163753
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180601474
OCPQ01052891
345314
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180601419
OCPQ01040793
237963
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180601437
OCPQ01044370
254433
Bacillota
TAC
Val
>WENV180601549
OCPQ01073620
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180601292
OCPQ01020767
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180601267
OCPQ01017171
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180601087
OCPQ01006048
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180601417
OCPQ01040793
279635
Bacillota
GTG
His
>WENV180601357
OCPQ01028101
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180600868
OCPQ01001980
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180601311
OCPQ01023532
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601028
OCPQ01004771
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180601513
OCPQ01059771
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180600758
OCPQ01000974
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180601636
OCPQ01128976
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180601007
OCPQ01004453
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180601316
OCPQ01023532
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180600965
OCPQ01003765
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180600869
OCPQ01002086
277200
Bacillota
GGC
Ala
>WENV180601594
OCPQ01096078
235292
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180601297
OCPQ01021294
353527
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180601293
OCPQ01021294
353527
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180600628
OCPQ01000483
243098
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180601195
OCPQ01011154
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180601164
OCPQ01009492
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180601104
OCPQ01006369
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180601393
OCPQ01035252
144762
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180601240
OCPQ01014777
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180600981
OCPQ01003975
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180601254
OCPQ01015807
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180600879
OCPQ01002232
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180600434
OCPQ01000069
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601508
OCPQ01059043
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180600812
OCPQ01001439
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180601250
OCPQ01015410
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180600937
OCPQ01003160
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180600895
OCPQ01002347
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180601314
OCPQ01023532
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180600917
OCPQ01002868
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180600301
OCPQ01000001
338127
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180601102
OCPQ01006342
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180600739
OCPQ01000876
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180600597
OCPQ01000400
114075
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180600972
OCPQ01003882
119513
Bacillota
CAA
Leu
>WENV180601472
OCPQ01052322
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601225
OCPQ01013284
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601048
OCPQ01005309
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601022
OCPQ01004763
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180600719
OCPQ01000799
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180600718
OCPQ01000799
238945
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601640
OCPQ01129071
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601385
OCPQ01033747
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601347
OCPQ01027090
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601233
OCPQ01014113
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601156
OCPQ01009447
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601121
OCPQ01007125
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601113
OCPQ01006861
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601052
OCPQ01005482
249259
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180601642
OCPQ01129080
338207
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180601067
OCPQ01005605
338207
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180600949
OCPQ01003457
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180600795
OCPQ01001332
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180600878
OCPQ01002232
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180600526
OCPQ01000223
245344
Bacillota
GAA
Phe
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK