This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
192 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV183608556
OODQ01000001
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183608557
OODQ01000001
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608554
OODQ01000001
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV183608593
OODQ01000009
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183608592
OODQ01000009
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183608590
OODQ01000009
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183608623
OODQ01000023
37549
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183608618
OODQ01000023
243119
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183608619
OODQ01000023
152459
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183608622
OODQ01000023
419945
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183608624
OODQ01000023
152051
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183608621
OODQ01000023
384950
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608638
OODQ01000031
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183608645
OODQ01000036
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608653
OODQ01000045
152046
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183608660
OODQ01000047
152047
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183608656
OODQ01000047
16820
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183608658
OODQ01000047
342736
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183608669
OODQ01000052
243098
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183608672
OODQ01000058
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183608678
OODQ01000063
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183608682
OODQ01000063
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183608683
OODQ01000063
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608679
OODQ01000063
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608680
OODQ01000063
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV183608676
OODQ01000063
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV183608686
OODQ01000064
243401
Bacillota
CGT
Thr
>WENV183608693
OODQ01000067
152513
Bacillota
GAC
Val
>WENV183608692
OODQ01000067
152513
Bacillota
GAC
Val
>WENV183608694
OODQ01000068
425593
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183608695
OODQ01000068
152512
Bacillota
CCT
Arg
>WENV183608700
OODQ01000068
152045
Bacillota
CAT
Met
>WENV183608699
OODQ01000068
281472
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183608702
OODQ01000070
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183608703
OODQ01000070
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183608714
OODQ01000079
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183608715
OODQ01000079
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183608722
OODQ01000092
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183608741
OODQ01000106
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183608746
OODQ01000114
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608747
OODQ01000116
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183608751
OODQ01000125
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183608752
OODQ01000125
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183608754
OODQ01000129
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183608756
OODQ01000129
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183608770
OODQ01000154
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183608774
OODQ01000157
296878
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183608776
OODQ01000157
248683
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183608775
OODQ01000157
344183
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183608778
OODQ01000157
304759
Bacillota
TAC
Val
>WENV183608777
OODQ01000157
243398
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183608773
OODQ01000157
384950
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608780
OODQ01000162
238745
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183608785
OODQ01000173
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183608789
OODQ01000184
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183608796
OODQ01000195
302150
Bacillota
TAC
Val
>WENV183608800
OODQ01000201
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV183608801
OODQ01000202
293599
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183608802
OODQ01000203
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183608806
OODQ01000205
152459
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183608803
OODQ01000205
152459
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183608807
OODQ01000205
81644
Bacillota
GAG
Leu
>WENV183608805
OODQ01000205
81644
Bacillota
GAG
Leu
>WENV183608808
OODQ01000205
37588
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183608812
OODQ01000211
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183608813
OODQ01000211
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183608811
OODQ01000211
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183608821
OODQ01000222
419639
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183608820
OODQ01000222
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608818
OODQ01000222
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183608819
OODQ01000222
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183608826
OODQ01000232
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183608835
OODQ01000250
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183608847
OODQ01000269
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608846
OODQ01000269
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183608851
OODQ01000279
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183608853
OODQ01000279
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183608852
OODQ01000279
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183608854
OODQ01000279
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183608864
OODQ01000307
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183608877
OODQ01000354
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608882
OODQ01000366
193585
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183608880
OODQ01000366
193585
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183608883
OODQ01000366
10943
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183608881
OODQ01000366
10943
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183608888
OODQ01000390
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183608892
OODQ01000397
37551
Bacillota
CGA
Ser
>WENV183608903
OODQ01000431
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV183608908
OODQ01000454
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV183608911
OODQ01000458
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608917
OODQ01000469
10926
Bacillota
CGA
Ser
>WENV183608934
OODQ01000521
384950
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183608936
OODQ01000529
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183608939
OODQ01000532
296878
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183608941
OODQ01000532
248683
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183608937
OODQ01000532
243399
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183608940
OODQ01000532
344183
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183608942
OODQ01000532
243398
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183608938
OODQ01000532
152051
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183608944
OODQ01000538
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183608950
OODQ01000558
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183608951
OODQ01000559
298639
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183608957
OODQ01000566
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183608959
OODQ01000572
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183608958
OODQ01000572
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183608966
OODQ01000584
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183608965
OODQ01000584
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183608984
OODQ01000654
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183608987
OODQ01000673
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183608997
OODQ01000717
309417
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183609006
OODQ01000746
302150
Bacillota
TAC
Val
>WENV183609007
OODQ01000747
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV183609023
OODQ01000798
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183609031
OODQ01000859
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183609032
OODQ01000859
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183609029
OODQ01000859
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183609030
OODQ01000859
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183609062
OODQ01001058
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183609067
OODQ01001127
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183609069
OODQ01001127
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183609077
OODQ01001176
340080
Bacillota
CCT
Arg
>WENV183609084
OODQ01001238
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183609089
OODQ01001238
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183609083
OODQ01001238
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183609091
OODQ01001255
298639
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183609100
OODQ01001283
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV183609101
OODQ01001307
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV183609102
OODQ01001308
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183609105
OODQ01001363
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV183609112
OODQ01001388
148239
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183609113
OODQ01001388
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV183609106
OODQ01001388
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183609119
OODQ01001414
45784
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183609128
OODQ01001646
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183609129
OODQ01001648
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183609134
OODQ01001706
238746
Bacillota
CGT
Thr
>WENV183609135
OODQ01001756
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183609150
OODQ01001879
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183609157
OODQ01001941
298620
Bacillota
CAT
Met
>WENV183609158
OODQ01001992
18852
Bacillota
GCT
Ser
>WENV183609170
OODQ01002131
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183609175
OODQ01002178
342979
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183609180
OODQ01002248
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183609179
OODQ01002248
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV183609195
OODQ01002339
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV183609193
OODQ01002339
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV183609210
OODQ01002501
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV183609209
OODQ01002501
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV183609208
OODQ01002501
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV183609213
OODQ01002524
277200
Bacillota
GGC
Ala
>WENV183609219
OODQ01002611
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183609222
OODQ01002681
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183609247
OODQ01003142
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183609251
OODQ01003289
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV183609263
OODQ01003486
147639
Bacillota
ACG
Arg
>WENV183609258
OODQ01003486
239020
Bacillota
TTT
Lys
>WENV183609270
OODQ01003606
173810
Bacillota
CAT
Met
>WENV183609275
OODQ01003724
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183609279
OODQ01003906
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV183609289
OODQ01004069
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV183609293
OODQ01004120
156937
Bacillota
GTG
His
>WENV183609297
OODQ01004284
245298
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183609296
OODQ01004284
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV183609305
OODQ01005126
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183609307
OODQ01005126
429443
Bacillota
GCA
Cys
>WENV183609311
OODQ01005273
304022
Bacillota
GCC
Gly
>WENV183609310
OODQ01005273
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183609322
OODQ01005790
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV183609327
OODQ01005790
23769
Bacillota
TAA
Leu
>WENV183609325
OODQ01005790
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183609321
OODQ01005790
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV183609329
OODQ01005988
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV183609330
OODQ01006013
235098
Bacillota
GAC
Val
>WENV183609332
OODQ01006212
235294
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183609335
OODQ01006309
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV183609336
OODQ01006328
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV183609344
OODQ01006886
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV183609358
OODQ01008342
154063
Bacillota
CGG
Pro
>WENV183609362
OODQ01008354
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV183609386
OODQ01010950
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183609387
OODQ01010950
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV183609424
OODQ01016250
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183609440
OODQ01019130
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183609452
OODQ01020439
302150
Bacillota
TAC
Val
>WENV183609451
OODQ01020439
144599
Bacillota
GTC
Asp
>WENV183609454
OODQ01020439
100326
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV183609456
OODQ01020439
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV183609466
OODQ01022013
299139
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183609486
OODQ01028525
341763
Bacillota
CTC
Glu
>WENV183609496
OODQ01030728
247057
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183609499
OODQ01031077
235137
Bacillota
TGC
Ala
>WENV183609500
OODQ01031499
246023
Bacillota
TGC
Ala
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK