This is the navigation skips to jump to main contents
Jump to main contents.
tRNADB-CE
: tRNA gene database curated manually by experts
Takashi Abe
1
, Toshimichi Ikemura
2
, Junichi Sugahara
3
, Akio Kanai
3
, Yasuo Ohara
2
, Hiroshi Uehara
2
, Makoto Kinouchi
4
,
Shigehiko Kanaya
5
, Yuko Yamada
2
, Akira Muto
6
, Hachiro Inokuchi
2
1
. Niigata Univ.,
2
. Nagahama Inst. of Bio-Sci. and Tech.,
3
. Keio Univ.,
4
. Yamagata Univ.,
5
. NAIST,
6
. Hirosaki Univ.
Top
|
Keyword
|
BLAST
|
Download
|
HOW TO USE
tRNA genes obtained from an environmental sample assignable to Identical sequence group.
HIT:
156 sequence(s).
Download Sequence
View ClustalW result
Reliable assignment
Tentative assignment
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
>WENV180330108
OBKV01018850
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180330482
OBKV01074319
196621
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180329827
OBKV01007478
361659
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180330166
OBKV01022325
155958
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180330266
OBKV01034472
155958
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180330298
OBKV01038271
155958
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180330247
OBKV01032848
155113
Bacillota
CGG
Pro
>WENV180329638
OBKV01003254
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180329716
OBKV01004801
144612
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180329479
OBKV01001519
267649
Bacillota
TAC
Val
>WENV180330417
OBKV01056726
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329537
OBKV01002055
235134
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180330688
OBKV01168157
235287
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180330721
OBKV01209314
339890
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180330387
OBKV01053139
338152
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180330297
OBKV01038269
250201
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180330146
OBKV01021293
44854
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180329645
OBKV01003315
235154
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180330309
OBKV01039188
144577
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180329317
OBKV01000776
37071
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180329484
OBKV01001563
307003
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180329170
OBKV01000316
59312
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180330800
OBKV01279168
238910
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180329569
OBKV01002296
97943
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180329299
OBKV01000694
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180329129
OBKV01000252
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180328973
OBKV01000096
338147
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180330797
OBKV01279023
235150
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180330022
OBKV01014826
114359
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180329826
OBKV01007478
114359
Bacillota
TAG
Leu
>WENV180330237
OBKV01031126
235294
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180330023
OBKV01014826
338208
Bacillota
>WENV180329924
OBKV01010694
340802
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180329143
OBKV01000277
235114
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180329121
OBKV01000236
235114
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180329412
OBKV01001107
388249
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180330491
OBKV01075022
144668
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180330010
OBKV01014648
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180330003
OBKV01014413
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180330001
OBKV01014317
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180329490
OBKV01001619
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180329405
OBKV01001062
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180329037
OBKV01000155
429429
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180330463
OBKV01070340
41154
Bacillota
TAA
Leu
>WENV180329169
OBKV01000316
44859
Bacillota
AAG
Leu
>WENV180329576
OBKV01002332
186380
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180330358
OBKV01047006
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180330221
OBKV01028960
11034
Bacillota
GGA
Ser
>WENV180330481
OBKV01074319
235117
Bacillota
TAC
Val
>WENV180329531
OBKV01001950
338550
Bacillota
>WENV180329530
OBKV01001950
338550
Bacillota
>WENV180329529
OBKV01001950
338550
Bacillota
>WENV180329012
OBKV01000133
274189
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180330483
OBKV01074319
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180330330
OBKV01042123
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329093
OBKV01000206
235079
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180330031
OBKV01014826
144763
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180330376
OBKV01051415
235087
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180330242
OBKV01032073
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180329947
OBKV01012011
338149
Bacillota
CTC
Glu
>WENV180330587
OBKV01112621
271471
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180330029
OBKV01014826
144766
Bacillota
CAT
Met
>WENV180330402
OBKV01054375
37269
Bacillota
TGA
Ser
>WENV180330386
OBKV01053139
287000
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180329781
OBKV01006168
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180329314
OBKV01000770
169968
Bacillota
CAT
Met
>WENV180329939
OBKV01011559
413152
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180330290
OBKV01037453
162445
Bacillota
CAT
Met
>WENV180330705
OBKV01186940
201704
Bacillota
GAT
Ile
>WENV180329942
OBKV01011572
152492
Bacillota
GGG
Pro
>WENV180330689
OBKV01168157
411585
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180330177
OBKV01023523
235078
Bacillota
TAC
Val
>WENV180329091
OBKV01000206
235078
Bacillota
TAC
Val
>WENV180329923
OBKV01010694
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180329119
OBKV01000236
144610
Bacillota
GTG
His
>WENV180329183
OBKV01000350
353537
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180330418
OBKV01056726
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180329538
OBKV01002055
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180328972
OBKV01000094
240017
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180330776
OBKV01273488
411547
Bacillota
CTG
Gln
>WENV180330050
OBKV01015725
147684
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180330147
OBKV01021293
4624
Bacillota
GCT
Ser
>WENV180330415
OBKV01056726
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180329604
OBKV01002640
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180329575
OBKV01002332
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180329535
OBKV01002055
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180329470
OBKV01001450
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180328971
OBKV01000094
263765
Bacillota
TAC
Val
>WENV180328790
OBKV01000008
300148
Bacillota
TAC
Val
>WENV180328811
OBKV01000016
248683
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180330585
OBKV01111279
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180330109
OBKV01018850
235095
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180329824
OBKV01007478
150597
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180329499
OBKV01001676
419639
Bacillota
GCA
Cys
>WENV180330171
OBKV01023160
411549
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180329271
OBKV01000599
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180328998
OBKV01000122
235142
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180330433
OBKV01061369
148188
Bacillota
CCG
Arg
>WENV180330307
OBKV01039145
80612
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180329691
OBKV01004232
256380
Bacillota
>WENV180329783
OBKV01006168
235127
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180330619
OBKV01128414
163943
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180329599
OBKV01002576
298620
Bacillota
CAT
Met
>WENV180329148
OBKV01000281
298620
Bacillota
CAT
Met
>WENV180329828
OBKV01007478
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180329190
OBKV01000359
411739
Bacillota
TCC
Gly
>WENV180329995
OBKV01014119
235638
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329735
OBKV01005232
235638
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180330329
OBKV01042090
235124
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180330251
OBKV01033612
163753
Bacillota
TGG
Pro
>WENV180329825
OBKV01007478
237963
Bacillota
TTT
Lys
>WENV180329829
OBKV01007478
201667
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180330543
OBKV01092833
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180330267
OBKV01034505
338129
Bacillota
TGT
Thr
>WENV180329191
OBKV01000359
279635
Bacillota
GTG
His
>WENV180329605
OBKV01002640
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180329508
OBKV01001738
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180329409
OBKV01001099
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180329087
OBKV01000200
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180328791
OBKV01000008
157838
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180330144
OBKV01021268
144583
Bacillota
ACG
Arg
>WENV180329167
OBKV01000308
236037
Bacillota
GTG
His
>WENV180329137
OBKV01000277
144652
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180330425
OBKV01058960
247734
Bacillota
TGC
Ala
>WENV180330107
OBKV01018850
235171
Bacillota
CCA
Trp
>WENV180329818
OBKV01007269
238974
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180330243
OBKV01032073
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180330066
OBKV01016083
144621
Bacillota
GTT
Asn
>WENV180329142
OBKV01000277
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329066
OBKV01000185
235113
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329574
OBKV01002332
353527
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180330741
OBKV01236835
199895
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180330650
OBKV01146254
243098
Bacillota
GGT
Thr
>WENV180330778
OBKV01273636
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180329640
OBKV01003254
58712
Bacillota
CAG
Leu
>WENV180330024
OBKV01014826
144762
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180330353
OBKV01045694
245296
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180330476
OBKV01073444
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180329948
OBKV01012011
272992
Bacillota
CTT
Lys
>WENV180329498
OBKV01001676
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180329219
OBKV01000412
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180329180
OBKV01000346
344240
Bacillota
GCC
Gly
>WENV180329496
OBKV01001676
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180329206
OBKV01000404
196632
Bacillota
GTC
Asp
>WENV180329025
OBKV01000144
178024
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180329922
OBKV01010694
157635
Bacillota
TCT
Arg
>WENV180330234
OBKV01030813
144594
Bacillota
CAC
Val
>WENV180329140
OBKV01000277
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180329061
OBKV01000179
95563
Bacillota
GTA
Tyr
>WENV180328893
OBKV01000043
338127
Bacillota
TTG
Gln
>WENV180329794
OBKV01006444
414486
Bacillota
CCC
Gly
>WENV180329782
OBKV01006168
272488
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180330016
OBKV01014826
338207
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180330601
OBKV01121361
338128
Bacillota
TTC
Glu
>WENV180329497
OBKV01001676
245344
Bacillota
GAA
Phe
>WENV180329207
OBKV01000404
245344
Bacillota
GAA
Phe
Select
Sequence ID
Genome ID
(or Accession No.)
Identical group No.
Phylum/Class
(Sample source for ENV)
Anticodon
AA
Download Sequence
View ClustalW result
BACK